El “7o Taller sobre el Mapeo de QTL y la Simulación Fitogenética” fue celebrado en el CIMMYT en El Batán, los días 20 y 21 de enero del año en curso. En el taller, que duró dos días, se examinaron el software y las tecnologías avanzadas que se aplican en el fitomejoramiento. En él participaron, sin costo alguno, todos los científicos del CIMMYT y del Programa de Reto Generation (GCP, siglas en inglés), así como los consultores, estudiantes y visitantes interesados en el tema, que estaban de paso en El Batán. El taller contó con la presencia de 28 científicos provenientes de diversos programas del CIMMYT y fue inaugurado por Marianne Bänziger, subdirectora general del Centro.
El primer día del curso, dirigido por Jiankang Wang, científico del CIMMYT, junto con Scott Chapman y Mark Dieters, investigadores del GCP, se centró en el tema de cómo modelar los programas fitogenéticos para poder lograr avances genéticos más rápidamente y utilizar la información sobre genes conocidos más eficientemente. Con ese fin, los participantes aprendieron las minucias de programas de software como QU-GENE, una plataforma de investigación de la genética cuantitativa, y QuLine, una herramienta de simulación fitogenética que se utiliza en los programas de mejoramiento de líneas endogámicas.
QuLine tiene la capacidad de simular la mayoría de las metodologías que se utilizan para generar líneas endogámicas. Se le ha utilizado para comparar diferentes estrategias de selección; estudiar los efectos de la dominancia y la epistasis en la selección; predecir el comportamiento de las cruzas con base en información acerca de genes conocidos; optimizar la selección asistida por marcadores a fin de conjuntar, en forma piramidal y con eficiencia, numerosos genes; e investigar la aplicación de asociaciones identificadas entre QTL y marcadores, y de métodos fitogenéticos basados en el diseño para mejorar la calidad del arroz, entre otras cosas. Al final del primer día, Ravi Singh, investigador de trigo, comentó: “Soy un fuerte partidario de utilizar la simulación para evaluar el potencial de las nuevas tecnologías”. Y aunque el software no sea perfecto, Singh, viendo hacia el futuro, agregó: “Su verdadero valor se revelará cuando tengamos información sobre genes conocidos y simulaciones computarizadas que nos indiquen cuáles cruzas debemos hacer. La simulación será una gran ayuda tanto para los mejoradores jóvenes como para los de experiencia”.
El segundo día del taller, dirigido por Wang, se centró en el mapeo de QTL. El acelerado incremento en el número de mapas de fina escala de marcadores genéticos ha conducido a que se aplique intensamente el mapeo de QTL para estudiar caracteres cuantitativos. Sin embargo, la construcción de mapas de ligamiento y mapas de QTL son dos pasos diferentes. Hay software para construir mapas de ligamiento y otros para construir mapas de QTL. Ningún software hace las dos cosas. No obstante, en 2010, Wang y sus colegas de la Academia China de Ciencias Agrícolas (CAAS, siglas en inglés) implementaron la construcción de mapas en el software QTL IciMapping con el respaldo del GCP y varios proyectos chinos. En consecuencia, QTL IciMapping es el único software que integra la construcción de mapas de ligamiento con la construcción de mapas de QTL, lo cual le ahorra a los investigadores tiempo invaluable cuando utilizan el mapeo de QTL para identificar genes que confieren caracteres importantes.
Los participantes reconocieron que el software tiene una gran funcionalidad e interfaces útiles para el usuario. Al final del segundo día, Sybil Herrera, científica asociada del CIMMYT, comentó: “Me parece genial que ahora podamos construir mapas de ligamiento con el software QTL IciMapping. Antes teníamos que utilizar un software para construir el mapa y otro para hacer el mapeo de los QTL. Tomaba mucho tiempo trabajar en el formato del software utilizado para construir los mapas y luego pasar al formato del software para el mapeo de QTL”.
El taller resultó ser todo un éxito y un excelente ejemplo de la impartición de conocimientos y del fortalecimiento de capacidades. Al fin del segundo día, los participantes habían adquirido conocimientos detallados de los programas de software en cuestión y, por su parte, los expertos habían reunido una lista de sugerencias y tips para mejorar las herramientas de la simulación fitogenética y el software para elaborar mapas de QTL.
Gracias a todas las personas que contribuyeron a la realización del taller.